Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprnQ60673 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprnQ60673 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprnQ60673 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprnQ60673 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprnQ60673 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprnQ60673 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprnQ60673 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprnQ60673 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprnQ60673 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprnQ60673 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprnQ60673 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprnQ60673 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprnQ60673 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprnQ60673 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprnQ60673 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms