Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sik1Q60670 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sik1Q60670 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms