Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf123Q5XPI3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms