Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajc11Q5U458 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnajc11Q5U458 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnajc11Q5U458 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms