Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms