Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Brip1Q5SXJ3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms