Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myh1Q5SX40 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms