Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms