Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd40Q5SUE8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms