Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bbs12Q5SUD9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bbs12Q5SUD9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 517.3 ms