Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zzef1Q5SSH7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zzef1Q5SSH7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms