Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fam46cQ5SSF7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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