Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS00

Zdbf2, DBF4-type zinc finger-containing protein 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zdbf2Q5SS00 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zdbf2Q5SS00 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zdbf2Q5SS00 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zdbf2Q5SS00 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zdbf2Q5SS00 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zdbf2Q5SS00 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zdbf2Q5SS00 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zdbf2Q5SS00 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zdbf2Q5SS00 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zdbf2Q5SS00 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zdbf2Q5SS00 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zdbf2Q5SS00 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zdbf2Q5SS00 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zdbf2Q5SS00 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zdbf2Q5SS00 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zdbf2Q5SS00 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zdbf2Q5SS00 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zdbf2Q5SS00 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Zdbf2Q5SS00 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zdbf2Q5SS00 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zdbf2Q5SS00 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zdbf2Q5SS00 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zdbf2Q5SS00 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zdbf2Q5SS00 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zdbf2Q5SS00 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zdbf2Q5SS00 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zdbf2Q5SS00 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zdbf2Q5SS00 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zdbf2Q5SS00 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zdbf2Q5SS00 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zdbf2Q5SS00 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zdbf2Q5SS00 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zdbf2Q5SS00 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zdbf2Q5SS00 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zdbf2Q5SS00 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zdbf2Q5SS00 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zdbf2Q5SS00 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zdbf2Q5SS00 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zdbf2Q5SS00 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zdbf2Q5SS00 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zdbf2Q5SS00 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zdbf2Q5SS00 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zdbf2Q5SS00 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zdbf2Q5SS00 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms