Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf12Q5SPL2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf12Q5SPL2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms