Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms