Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlha9Q5RJB0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlha9Q5RJB0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms