Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Trim41Q5NCC3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Trim41Q5NCC3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Trim41Q5NCC3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Trim41Q5NCC3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Trim41Q5NCC3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Trim41Q5NCC3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Trim41Q5NCC3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Trim41Q5NCC3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Trim41Q5NCC3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Trim41Q5NCC3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Trim41Q5NCC3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Trim41Q5NCC3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Trim41Q5NCC3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Trim41Q5NCC3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Trim41Q5NCC3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Trim41Q5NCC3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Trim41Q5NCC3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Trim41Q5NCC3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Trim41Q5NCC3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms