Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1810065E05RikQ5NC41 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
1810065E05RikQ5NC41 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1810065E05RikQ5NC41 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms