Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

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Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrc3Q5DU56 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Nlrc3Q5DU56 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Nlrc3Q5DU56 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Nlrc3Q5DU56 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms