Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

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Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp13Q5BKP2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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