Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms