Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZGD9

Nxf3, Nuclear RNA export factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf3Q4ZGD9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nxf3Q4ZGD9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms