Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA53

Pds5b, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5bQ4VA53 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Pds5bQ4VA53 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Pds5bQ4VA53 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms