Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc3lQ4KL14 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc3lQ4KL14 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc3lQ4KL14 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms