Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0K9

Snhg11, Small nucleolar RNA host gene 11, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snhg11Q4G0K9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snhg11Q4G0K9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snhg11Q4G0K9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snhg11Q4G0K9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snhg11Q4G0K9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snhg11Q4G0K9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snhg11Q4G0K9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snhg11Q4G0K9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snhg11Q4G0K9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snhg11Q4G0K9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Snhg11Q4G0K9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snhg11Q4G0K9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snhg11Q4G0K9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snhg11Q4G0K9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Snhg11Q4G0K9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snhg11Q4G0K9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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