Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Krt35Q497I4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt35Q497I4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms