Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ulk4Q3V129 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ulk4Q3V129 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ulk4Q3V129 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms