Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0U0

1700057G04Rik, Phospholipid scramblase, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700057G04RikQ3V0U0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700057G04RikQ3V0U0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700057G04RikQ3V0U0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms