Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd53Q3V0J4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd53Q3V0J4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms