Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp48Q3V0C5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms