Protein–RNA interactions for Protein: Q3V050

Slc47a2, Multidrug and toxin extrusion protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a2Q3V050 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc47a2Q3V050 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc47a2Q3V050 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc47a2Q3V050 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc47a2Q3V050 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc47a2Q3V050 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc47a2Q3V050 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc47a2Q3V050 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc47a2Q3V050 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc47a2Q3V050 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc47a2Q3V050 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc47a2Q3V050 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc47a2Q3V050 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc47a2Q3V050 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms