Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc27Q3V036 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc27Q3V036 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms