Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW31

Pate2, Prostate and testis expressed protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate2Q3UW31 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pate2Q3UW31 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pate2Q3UW31 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms