Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chpf2Q3UU43 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Chpf2Q3UU43 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms