Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
B230104I21RikQ3USW4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms