Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Fchsd2Q3USJ8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fchsd2Q3USJ8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fchsd2Q3USJ8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms