Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQU0

Brd9, Bromodomain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd9Q3UQU0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd9Q3UQU0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd9Q3UQU0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd9Q3UQU0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd9Q3UQU0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd9Q3UQU0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd9Q3UQU0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd9Q3UQU0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd9Q3UQU0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd9Q3UQU0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd9Q3UQU0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd9Q3UQU0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd9Q3UQU0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd9Q3UQU0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd9Q3UQU0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd9Q3UQU0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd9Q3UQU0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd9Q3UQU0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd9Q3UQU0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd9Q3UQU0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd9Q3UQU0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd9Q3UQU0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd9Q3UQU0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brd9Q3UQU0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd9Q3UQU0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms