Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbm20Q3UQS8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbm20Q3UQS8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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