Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms