Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrxosQ3UL53 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrxosQ3UL53 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms