Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ell2Q3UKU1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms