Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smu1Q3UKJ7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smu1Q3UKJ7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms