Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zswim8Q3UHH1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zswim8Q3UHH1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zswim8Q3UHH1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms