Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH06

Rreb1, Ras-responsive element-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rreb1Q3UH06 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rreb1Q3UH06 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rreb1Q3UH06 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rreb1Q3UH06 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rreb1Q3UH06 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rreb1Q3UH06 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rreb1Q3UH06 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rreb1Q3UH06 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rreb1Q3UH06 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rreb1Q3UH06 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rreb1Q3UH06 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms