Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef3Q3UGY8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms