Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Puf60Q3UEB3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Puf60Q3UEB3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms