Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pid1Q3UBG2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pid1Q3UBG2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms