Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf180Q3U827 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf180Q3U827 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf180Q3U827 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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