Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U6N9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U6N9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U6N9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3U6N9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q3U6N9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U6N9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U6N9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q3U6N9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U6N9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U6N9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U6N9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3U6N9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms