Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hectd3Q3U487 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hectd3Q3U487 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms