Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Vars2Q3U2A8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vars2Q3U2A8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vars2Q3U2A8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms